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“人類DNA序列是人類的真諦,這個世界上發生的一切事情,都與這一序列息息相關。”

——諾貝爾生理學與醫學獎獲得者杜伯克

在基因這本“生命天書”里,藏著有關健康的秘密,人類通過基因探索生命科學的腳步從未停歇。然而,對生命科學的探究離不開對基因數據信息的存儲、挖掘、管理。其數據信息的巨大規模、結構復雜、快速增長等特點,對信息系統的存儲能力、計算能力、擴展能力都提出了非常高的要求,成為許多科研單位進一步取得成果所面臨的難題。

作為國內信息技術領軍企業,曙光憑借卓越的綜合實力為眾多科研單位開展生命科學領域相關研究提供了有力保障。首都醫科大學附屬北京天壇醫院(以下簡稱“北京天壇醫院”)生物信息分析與基因檢測系統項目便是曙光依托在生命科學領域多年來的經驗與優勢,為其提供的滿足科研需求的總體解決方案代表性案例。

北京天壇醫院是一所以神經外科為先導,神經科學為特色,集醫、教、研、防為一體的三級甲等綜合性醫院,是世界三大神經外科研究中心之一。基于生命科學領域科研需求,北京天壇醫院啟動構建高性能計算集群項目,并對計劃構建的計算集群提出了高標準技術要求。

通過深入調研用戶需求,曙光為天壇醫院生物信息分析與基因檢測系統項目提供了一套基于NVIDIA GPU的面向高通量基因組學數據處理與智能病理影像識別的高性能計算集群總體解決方案,為天壇醫院建設了生物信息分析系統、基因組數據管理軟硬件系統和醫學影像人工智能平臺,為生命科學研究提供了充足計算力。

此外,曙光憑借在高性能計算、存儲、大數據等領域的技術優勢,針對不同業務需求搭建各子系統,實現高效集成,形成包括面向序列對比和序列拼接的計算平臺、面向醫療影像處理的計算平臺、面向測序數據及影像數據的海量存儲及備份系統、高速網絡系統及生物信息應用軟件與工具、組學大數據分析流程系統、基因位點數據庫系統與可視化平臺的整體系統,有效整合數據信息資源,減輕了運維壓力,提高了科研效率。

系統中海量數據的安全也是重中之重,曙光安全產品為系統提供了全方位的安全保障,充分滿足醫院安全等級的要求。

后續測試證明,在原CPU集群上需用幾天時間才可處理完成的數據集,借由新構建的GPU集群助力,可將用時降低到以分鐘為單位,北京天壇醫院在生物信息處理、醫療影像識別、智能測序、生物大數據處理等應用上取得了長足的性能提升。曙光生物信息分析與基因檢測系統為北京天壇醫院各項生命科學研究的順利進行提供了可靠保障,促進其科研質量提高、科研周期縮短、科研成本降低,為北京天壇醫院進一步解碼生命科學,精準醫療技術取得突破提供了有力支撐。

以創新技術助力科研發展是曙光一直以來的努力方向,曙光將不斷發揮自身優勢,為各領域科學研究提供強有力的IT支持,助力前沿科技成果的取得,加快創新成果轉化應用,讓科技造福社會,為建設創新型國家保駕護航。

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