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過(guò)去科學(xué)研究通常有兩種范式,一種是基于歸納的范式,另一種是基于演繹的范式。這兩種研究范式有各自的特點(diǎn)也使得它們有不同的限制。

歸納與演繹結(jié)合,數(shù)量級(jí)提升物理模型效率

以藥物設(shè)計(jì)為例,由于其求解對(duì)象過(guò)于復(fù)雜,只能通過(guò)密度泛函這種底層、準(zhǔn)確的方式來(lái)求解,即使用演繹范式求解。

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這樣的求解是非常昂貴的,需要大量的算力支撐,因?yàn)樾枰?jì)算體系內(nèi)原子、分子間的相互作用和它們之間的能量,其本質(zhì)上是一個(gè)高維函數(shù)。

面對(duì)如此高成本的計(jì)算,深勢(shì)科技團(tuán)隊(duì)成員提出了Deep Potential系列方法,成功在傳統(tǒng)的演繹范式計(jì)算流程中加入了基于歸納范式的AI技術(shù),有效結(jié)合了兩種科學(xué)研究途徑的優(yōu)勢(shì)。

深勢(shì)科技團(tuán)隊(duì)將AI處理高維復(fù)雜函數(shù)的能力運(yùn)用于表示微觀粒子間相互作用對(duì)應(yīng)的標(biāo)量函數(shù),直接在分子動(dòng)力學(xué)的框架之下對(duì)原子體系進(jìn)行演化,大幅提升了藥物設(shè)計(jì)階段的效率。這套方法在完整保留第一性原理分子動(dòng)力學(xué)精度的同時(shí),把計(jì)算的速度提升到此前的多個(gè)數(shù)量級(jí),可以同時(shí)實(shí)現(xiàn)對(duì)數(shù)十億個(gè)原子第一性精度模擬。

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(對(duì)于有機(jī)分子、高熵合金、半導(dǎo)體等不同體系,DP均給出符合第一性原理DFT計(jì)算的結(jié)果)

Deep Potential在集合了歸納范式和演繹范式的優(yōu)勢(shì)之后,既有效地繼承了DFT精度,又大幅降低計(jì)算復(fù)雜度,同時(shí)計(jì)算效率還呈現(xiàn)出線性的擴(kuò)展。在這樣的底層原理的支撐下,機(jī)器學(xué)習(xí)、物理模型能真正有效地結(jié)合起來(lái),從而數(shù)量級(jí)地提升物理模型的效率。

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(克服維數(shù)災(zāi)難,計(jì)算量隨原子數(shù)量線性增長(zhǎng))

深度學(xué)習(xí)分子動(dòng)力學(xué),對(duì)算力提出要求

上述這種深度學(xué)習(xí)分子動(dòng)力學(xué)在大幅提升計(jì)算效率的同時(shí),也對(duì)基礎(chǔ)算力提出了新的需求。

首先,深度學(xué)習(xí)模塊的加入對(duì)異構(gòu)資源提出了新的需求:模型訓(xùn)練往往需要在海量異構(gòu)資源上進(jìn)行,以滿足模型的開(kāi)發(fā)迭代速度以及模型預(yù)測(cè)準(zhǔn)確度。

因此,為了將深度學(xué)習(xí)分子動(dòng)力學(xué)的優(yōu)勢(shì)最大化,需要充足的通用和異構(gòu)計(jì)算資源。其次,雖然深度學(xué)習(xí)分子動(dòng)力學(xué)大幅降低了計(jì)算成本,但面對(duì)比第一性原理分子動(dòng)力學(xué)更大規(guī)模的求解過(guò)程時(shí),深度學(xué)習(xí)分子動(dòng)力學(xué)仍然需要海量的算力資源,超大計(jì)算規(guī)模場(chǎng)景下所需的算力資源往往令大多數(shù)計(jì)算中心難以滿足,因此限制了深度學(xué)習(xí)分子動(dòng)力學(xué)在材料計(jì)算、藥物設(shè)計(jì)領(lǐng)域的應(yīng)用。

基于智算+API,完成海量計(jì)算資源對(duì)接

目前,曙光智算和深勢(shì)科技推出“多尺度模型+AI+高密度計(jì)算”聯(lián)合解決方案,底層使用曙光智算海量通用和異構(gòu)算力,支持超大規(guī)模作業(yè)任務(wù),為深度學(xué)習(xí)分子動(dòng)力學(xué)提供廣闊舞臺(tái),依靠“無(wú)界算力”徹底消除“算力不足恐懼癥”。

基于智算+API,深勢(shì)科技Lebesgue管理平臺(tái)已與曙光智算海量資源完成對(duì)接,并在計(jì)算中心成功部署DeePMD-kit、DP-GEN工具。背靠海量可擴(kuò)展計(jì)算資源,聯(lián)合解決方案打造高效的“AI+Science”研發(fā)新范式,助力臨床前藥物設(shè)計(jì)和新材料研發(fā)。

在藥物設(shè)計(jì)領(lǐng)域,解決方案集成深勢(shì)科技臨床前計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)平臺(tái) Hermite(hermite.dp.tech),借助深勢(shì)科技自主研發(fā)的全新藥物設(shè)計(jì)解決方案及眾多業(yè)界優(yōu)秀的藥物設(shè)計(jì)工具,以用戶友好的圖形化操作界面,提供了算法-數(shù)據(jù)-算力三位一體的一站式解決方案:蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)模塊 Uni-Fold 與增強(qiáng)采樣算法 RiD 可完成實(shí)驗(yàn)級(jí)精度的蛋白結(jié)構(gòu)建模與優(yōu)化和高效的正構(gòu)、別構(gòu)口袋預(yù)測(cè);虛擬篩選模塊可實(shí)現(xiàn)數(shù)十億分子庫(kù)量級(jí)的虛擬篩選;結(jié)合自由能計(jì)算模塊 Hermite Uni-FEP 將自由能微擾理論、分子動(dòng)力學(xué)、增強(qiáng)采樣算法與高性能計(jì)算相結(jié)合,以化學(xué)精度高效評(píng)估蛋白與配體的結(jié)合自由能,實(shí)現(xiàn)工業(yè)規(guī)模的先導(dǎo)化合物優(yōu)化篩選,提升藥物優(yōu)化效率。

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在材料計(jì)算領(lǐng)域,解決方案依靠曙光智算底層算力和深勢(shì)科技自研的新一代分子模擬技術(shù),能夠?qū)崿F(xiàn)效率與精度的統(tǒng)一,將過(guò)去業(yè)內(nèi)以“炒菜”式實(shí)驗(yàn)為主的試錯(cuò)式研發(fā)模式,逐漸轉(zhuǎn)變?yōu)椤坝?jì)算設(shè)計(jì)-實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證”的理性設(shè)計(jì)研發(fā)模式,將研發(fā)周期縮短至原來(lái)的十分之一。此外,這種新型科研基礎(chǔ)設(shè)施可以解決傳統(tǒng)方法難以計(jì)算的多元電極、離子輸運(yùn)、表面界面模擬問(wèn)題,有望為現(xiàn)有材料體系中的未解問(wèn)題給出解答,成為新能源材料研發(fā)升級(jí)的新引擎。




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